肉眼可見的巨型細(xì)菌具有前所未有的新陳代謝類型
科學(xué)家們首次對(duì)一種神秘的巨型細(xì)菌的基因組進(jìn)行了測(cè)序,這種細(xì)菌可以在沒有顯微鏡的情況下看到。
關(guān)于它們的繁殖策略、生存機(jī)制和獨(dú)特的代謝機(jī)制(類似于線粒體)的發(fā)現(xiàn)有朝一日可能有助于開發(fā)可持續(xù)能源技術(shù)和提高農(nóng)業(yè)效率。
Epulopiscium(埃普洛皮斯菌屬)細(xì)菌共生生活在魚的內(nèi)臟中,Naso tonganus,在熱帶海洋環(huán)境中。在大多數(shù)細(xì)菌太小而無(wú)法在沒有顯微鏡的情況下看到的地方,這些單細(xì)胞猛犸象的體積是其已知親戚的一百萬(wàn)倍,大腸桿菌,這意味著它們可以用肉眼辨認(rèn)出來(lái)。
“這種令人難以置信的巨型細(xì)菌在很多方面都是獨(dú)特而有趣的,”說(shuō)美國(guó)康奈爾大學(xué)的微生物學(xué)家Esther Anert?!敖沂具@種生物體的基因組潛力讓我們大吃一驚。
第一位成員Epulopiscium(埃普洛皮斯菌屬)——其名字來(lái)自拉丁語(yǔ)中的“客人”和“魚”——于 1985 年被發(fā)現(xiàn)。
安格特和她的美國(guó)同事為他們研究的物種命名Epulopiscium viviparus(胎生孢子菌):第二個(gè)詞指的是導(dǎo)致活產(chǎn)的繁殖。
雖然細(xì)菌通常會(huì)分成兩半以產(chǎn)生兩個(gè)新的細(xì)菌,E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌)可以在母細(xì)胞內(nèi)形成多達(dá) 12 個(gè)副本,然后游到世界上。
由于無(wú)法在實(shí)驗(yàn)室中生長(zhǎng),這種巨大的細(xì)菌仍然是生物界的好奇心。所以要學(xué)習(xí)E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌),研究人員必須捕獲它生活的魚,并盡快仔細(xì)收集細(xì)胞進(jìn)行DNA測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組分析。
大多數(shù)細(xì)菌要么使用氧氣呼吸,要么通過以下方式從環(huán)境中獲取能量發(fā)酵,這通常會(huì)導(dǎo)致能源產(chǎn)生減少。
E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌)碰巧是一個(gè)發(fā)酵罐,但這令人費(fèi)解,因?yàn)樗艽螅敝逞杆?,并且可以游泳——所有這些都需要相對(duì)大量的能量。
看起來(lái)這些細(xì)菌已經(jīng)優(yōu)化了它們的新陳代謝,使其適應(yīng)了富含鈉離子的魚類腸道環(huán)境。鈉離子流過細(xì)胞膜會(huì)產(chǎn)生強(qiáng)大的“鈉動(dòng)力”,用于產(chǎn)生能量并旋轉(zhuǎn)其毛發(fā)狀附屬物,稱為鞭毛用于運(yùn)動(dòng)。
這種鈉動(dòng)力也為鞭毛運(yùn)動(dòng)提供動(dòng)力霍亂弧菌,引起霍亂的細(xì)菌。
研究小組還發(fā)現(xiàn)了一大塊遺傳密碼E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌)使酶能夠有效地從宿主魚中提取營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),特別是從藻類中提取稱為多糖的碳水化合物,這些碳水化合物構(gòu)成了藻類的很大一部分湯加努斯奈瑟菌節(jié)食。
E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌)具有豐富的酶,使ATP酸加也是支持各種細(xì)胞過程的“能量貨幣”。他們?cè)谝粋€(gè)獨(dú)特的膜中發(fā)現(xiàn)了這些分子的空間,類似于線粒體更復(fù)雜的生物體。
“我們都知道”線粒體是細(xì)胞的動(dòng)力源“這句話,令人驚訝的是,這些膜E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌)與線粒體趨同于同一模型,“安格特說(shuō).
“它們有一個(gè)高度折疊的膜,增加了這些產(chǎn)生能量的泵可以工作的表面積,而增加的表面積創(chuàng)造了一個(gè)強(qiáng)大的能量源。
E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌)利用藻類中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的有效方法在未來(lái)可能會(huì)有很多用途。藻類作為一種可再生能源、牲畜和人類的食物來(lái)源正變得越來(lái)越受歡迎,因?yàn)樗纳L(zhǎng)不會(huì)干擾陸基農(nóng)業(yè)。
還有一些謎團(tuán)有待解開。正如Anert及其同事所指出的,需要進(jìn)一步的研究才能完全理解如何E. viviparus (薇薇帕魯斯大腸桿菌)使用其酶庫(kù)。但這為了解他們的生長(zhǎng)需求提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
“我們發(fā)現(xiàn)迄今為止已知最大的細(xì)菌沒有被分離出來(lái),這很了不起,”作者說(shuō)寫.“這表明細(xì)菌龐然大物經(jīng)過高度調(diào)整,可以在它們進(jìn)化的環(huán)境中生存。
該研究已發(fā)表在美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊.
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